- MLeap Scikit-Learn 集成
- 使用 MLeap 扩展 Scikit-Learn
- MLeap 中使用 Scikit-Learn Transformer 和 Pipeline
- 合并多个 Transformer
- 序列化为 ZIP 文件
- JSON 格式
- Protobuf 格式
- 反序列化
- Demos
- 使用 MLeap 扩展 Scikit-Learn
MLeap Scikit-Learn 集成
MLeap 为 Scikit-Learn 的 Pipeline、Transformer 以及特征联合添加了序列化为 Bundle 的能力,以保证 Scikit-Learn Transformer 和 Spark Transformer 功能上的一致。MLeap-Scikit 集成有两个主要的应用场景 :
- 序列化 Scikit-Learn Pipeline 并在 MLeap Runtime 中执行。
- 序列化 Scikit-Learn Pipeline,以及反序列化回 Spark Pipeline。
如我们之前所说,MLeap Runtime 目前仅提供了 Scala 的函数库,我们会在未来添加 Python 绑定支持,但目前已经完全能够不依赖于 Scikit-Learn 和 Numpy 去执行 Pipeline 了。
使用 MLeap 扩展 Scikit-Learn
Scikit-Learn Transformer 和 Spark Transformer 的运作存在以下几点重要区别:
- 所有的 Spark Transformer 都带有
name
、op
、inputCol
以及outputCol
属性,而 Scikit-Learn 并没有(ihainan: 不会全有,还是全部没有?)。 - Spark Transformer 可以作用于一个向量,而 Scikit-Learn Transformer 作用于一个 n 维数组和矩阵。
- Spark 是由 Scala 语言编写而成,因此可以非常方便地添加隐式方法和属性,Scikit-Learn 则使用了一点小技巧,要求用户去调用
setattr()
方法。
由于这三个额外的差异,在使用 MLeap 来扩展 Scikit-Learn 的功能时,需要遵循一些规范。
首先,我们必须初始化每一个 Transformer,使其包含如下属性:
- Op: 唯一的
op
名字,用于链接基于 Spark 的 Transformer(例如,Scikit-Learn 和 Spark 中的 Standard Scaler 是等价的,因为我们需要用op
值standard_scaler
来表示这个 Transformer)。 - Name: 为每一个 Transformer 提供唯一的 name。例如,如果你有多个 Standard Scaler 实例,那么每一个实例都需要提供独一无二的 name。
- Input Column:严格用在序列化过程,指明输入字段是什么。
- Output Column:严格用在序列化过程,指明输出字段是什么。
MLeap 中使用 Scikit-Learn Transformer 和 Pipeline
首先导入所有必要的依赖库:
# Initialize MLeap libraries before Scikit/Pandas
import mleap.sklearn.preprocessing.data
import mleap.sklearn.pipeline
from mleap.sklearn.preprocessing.data import FeatureExtractor
# Import Scikit Transformer(s)
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.pipeline import Pipeline
然后使用 Pandas 创建一帧测试用的 DataFrame
# Create a pandas DataFrame
df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 5), columns=['a', 'b', 'c', 'd', 'e'])
让我们定义两个 Transformer,一个为特征提取器(FeatureExtractor),用于提取我们想要进行归一化的字段,以及一个 Standard Scaler,用于执行标准归一化操作。
# Initialize a FeatureExtractor, which subselects only the features we want
# to run the Standard Scaler against
input_features = ['a', 'c', 'd']
output_vector_name = 'unscaled_continuous_features' # Used only for serialization purposes
output_features = ["{}_scaled".format(x) for x in input_features]
feature_extractor_tf = FeatureExtractor(input_scalars=input_features,
output_vector=output_vector_name,
output_vector_items=output_features)
# Define the Standard Scaler as we normally would
standard_scaler_tf = StandardScaler(with_mean=True,
with_std=True)
# Execute ML-Init to add the require attributes to the transformer object
# Op and Name will be initialized automatically
standard_scaler_tf.mlinit(prior_tf=feature_extractor_tf,
output_features='scaled_continuous_features')
现在我们已经定义好了 Transformer,接下来需要把它们组装为 Pipeline,并对 Data Frame 执行转换操作。
# Now let's create a small pipeline using the Feature Extractor and the Standard Scaler
standard_scaler_pipeline = Pipeline([(feature_extractor_tf.name, feature_extractor_tf),
(standard_scaler_tf.name, standard_scaler_tf)])
standard_scaler_pipeline.mlinit()
# Now let's run it on our test DataFrame
standard_scaler_pipeline.fit_transform(df)
# Printed output
array([[ 0.2070446 , 0.30612846, -0.91620529],
[ 0.81463009, -0.26668287, 1.95663995],
[-0.94079041, -0.18882131, -0.0462197 ],
[-0.43931405, 0.13214763, -0.10700743],
[ 0.43992551, -0.2985418 , -0.89093752],
[-0.15391539, -2.20828471, 0.5361159 ],
[-1.07689244, 1.61019861, 1.42868885],
[ 0.87874789, 1.43146482, -0.44362038],
[-1.60105094, -0.40130005, -0.10754886],
[ 1.87161513, -0.11630878, -1.40990552]])
合并多个 Transformer
我们演示了如何将 Transformer 作用于一系列特征之上,但是这个操作的输出仅仅只是一个 n 维的数组,如果我们需要把它提供如回归模型这样的模型使用的话,还需要将原始的数据与这个输出联合在一起。让我们看下如何使用特征联合来将多个 Transformer 的结果联合在一起。
首先,我们继续创建一个新的 Transformer:一个 MinMaxScaler,作用于 Data Frame 中剩下的两个特征之上。
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
input_features_min_max = ['b', 'e']
output_vector_name_min_max = 'unscaled_continuous_features_min_max' # Used only for serialization purposes
output_features_min_max = ["{}_min_maxscaled".format(x) for x in input_features_min_max]
feature_extractor_min_max_tf = FeatureExtractor(input_scalars=input_features_min_max,
output_vector=output_vector_name_min_max,
output_vector_items=output_features_min_max)
# Define the MinMaxScaler as we normally would
min_maxscaler_tf = MinMaxScaler()
# Execute ML-Init to add the require attributes to the transformer object
# Op and Name will be initialized automatically
min_maxscaler_tf.mlinit(prior_tf=feature_extractor_min_max_tf,
output_features='min_max_scaled_continuous_features')
# Assemble our MinMaxScaler Pipeline
min_max_scaler_pipeline = Pipeline([(feature_extractor_min_max_tf.name, feature_extractor_min_max_tf),
(min_maxscaler_tf.name, min_maxscaler_tf)])
min_max_scaler_pipeline.mlinit()
# Now let's run it on our test DataFrame
min_max_scaler_pipeline.fit_transform(df)
array([[ 0.58433367, 0.72234095],
[ 0.21145259, 0.72993807],
[ 0.52661493, 0.59771784],
[ 0.29403088, 0.19431993],
[ 0.48838789, 1. ],
[ 1. , 0.46456522],
[ 0.36402459, 0.43669119],
[ 0. , 0.74182958],
[ 0.60312285, 0. ],
[ 0.33707035, 0.39792128]])
最后,让我们使用特征联合来合并两个 Pipeline。需要注意的是在合并之前,你无需去执行 Pipeline 的 fit
或者 fit_transform
操作。
# Import MLeap extension to Feature Unions
import mleap.sklearn.feature_union
# Import Feature Union
from sklearn.pipeline import FeatureUnion
feature_union = FeatureUnion([
(standard_scaler_pipeline.name, standard_scaler_pipeline),
(min_max_scaler_pipeline.name, min_max_scaler_pipeline)
])
feature_union.mlinit()
# Create pipeline out of the Feature Union
feature_union_pipeline = Pipeline([(feature_union.name, feature_union)])
feature_union_pipeline.mlinit()
# Execute it on our data frame
feature_union_pipeline.fit_transform(df)
array([[ 0.2070446 , 0.30612846, -0.91620529, 0.58433367, 0.72234095],
[ 0.81463009, -0.26668287, 1.95663995, 0.21145259, 0.72993807],
[-0.94079041, -0.18882131, -0.0462197 , 0.52661493, 0.59771784],
[-0.43931405, 0.13214763, -0.10700743, 0.29403088, 0.19431993],
[ 0.43992551, -0.2985418 , -0.89093752, 0.48838789, 1. ],
[-0.15391539, -2.20828471, 0.5361159 , 1. , 0.46456522],
[-1.07689244, 1.61019861, 1.42868885, 0.36402459, 0.43669119],
[ 0.87874789, 1.43146482, -0.44362038, 0. , 0.74182958],
[-1.60105094, -0.40130005, -0.10754886, 0.60312285, 0. ],
[ 1.87161513, -0.11630878, -1.40990552, 0.33707035, 0.39792128]])
序列化为 ZIP 文件
为了序列化为 Zip 文件,需要确保 URL 以 jar:file
开头,以 .zip
结尾。
For example jar:file:/tmp/mleap-bundle.zip
.
例如: jar:file:/tmp/mleap-bundle.zip
.
JSON 格式
设置 init=Ture
告知序列化器我们创建一个 Bundle,而非仅仅只是序列化 Transformer。
feature_union_pipeline.serialize_to_bundle('/tmp', 'mleap-bundle', init=True)
Protobuf 格式
即将支持。
反序列化
即将支持。
Demos
完整的 Demo 可从 Github 获取,Demo 展示了 Transformer、Pipeline、特征联合以及序列化的完整用法。